在太一一行人（rén）告別數碼世（shì）界後，數碼世界並沒有就此關閉朝向人類的大門，而數碼（mǎ）世（shì）界的（de）內部卻沒有太平多（duō）少（shǎo）時日，就又開始了紛爭（zhēng）。 數碼世界急需一批被選中的孩子來維護數（shù）碼世（shì）界和人類世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先後成為了初中（zhōng）生，沒有太多精力和時間能夠和數碼寶貝們一起並肩作戰，隻有阿武和（hé）小光成為（wéi）了新一代的（de）領（lǐng）頭人（rén）。被選中的孩子有本宮大輔（木內玲子 配音）、井之上京（jīng）（夏樹莉緒 配音