工藤新一是（shì）全國著名的高中生偵探，在一次追查黑衣人犯罪團夥（huǒ）時不幸被團夥成員發現，擊暈後喂了神奇的（de）藥（yào）水，工藤新一變回了小孩！新一找到了經常幫助他的阿（ā）笠博士，博士（shì）為他度身打（dǎ）造不少間諜武器。為了防止犯罪團夥對他進行報複，新一決定隱姓埋名，暗中追（zhuī）查他（tā）們，希望能得（dé）到解（jiě）藥。一日，新一的（de）女友毛利蘭來到（dào）了阿笠博士的家尋（xún）找男友（yǒu）的下落，被小（xiǎo）蘭撞（zhuàng）見的新一情急之下編造了自己（jǐ）名叫江戶川柯（kē）南，隨後柯南寄居在了小蘭（lán）家。小蘭的父親毛利小五（wǔ）郎是一名私家偵探，新一可以籍著和他一起四出辦案一起追查黑夜人的（de）下落。柯南在小學認識步美（měi）等小學生，他們一