工藤新一是全國著名的高中生偵探，在一次追查黑衣人犯罪團夥時（shí）不幸被團夥成員發現，擊暈後喂了神奇的藥水，工藤新一變回了（le）小孩！新一找到（dào）了經常幫助他的阿笠博士，博士為他度身打造不少（shǎo）間諜武器。為了（le）防止犯罪團夥（huǒ）對他進行報複，新一決定（dìng）隱姓埋名，暗中追查他們，希望能得到解藥。一日，新一的女友毛利蘭來到（dào）了阿笠博士的家尋找男友的下落，被小蘭撞（zhuàng）見的新一情急之下編造了自己名（míng）叫江戶川柯（kē）南，隨後柯（kē）南寄居在了小蘭家。小蘭的父親毛利小五郎是一名私（sī）家偵（zhēn）探，新一可以籍著和他一起四出辦案一起追查黑夜人的下落。柯（kē）南（nán）在小學認（rèn）識步美等小（xiǎo）學（xué）生，他們一