工藤新一是全國著名的高中（zhōng）生偵探，在一次追查（chá）黑衣人（rén）犯罪團夥時不幸被團（tuán）夥成員發現，擊暈後喂了神（shén）奇的藥水，工藤新一變回了小孩！新一（yī）找到了經常幫（bāng）助他的阿笠博士，博士為他度身打造不少間（jiān）諜武器。為了防止犯（fàn）罪團夥對他進行報複，新一決定隱姓埋名，暗中追查他們（men），希望（wàng）能得到解藥。一日，新一的女友（yǒu）毛利蘭來到了阿笠博士的家（jiā）尋找男（nán）友的（de）下落，被（bèi）小（xiǎo）蘭撞見的新一情急之下編造了自己名叫江戶川柯南，隨後柯南寄居在了小（xiǎo）蘭家。小蘭的父親毛利小五郎是一名私家偵探，新一可以籍著（zhe）和他一起四出辦案一起追查黑夜人的下落。柯南在小學（xué）認識步美等小學生，他（tā）們一